Признаки определяются генами. Каждый ген состоит из двух аллелей (одна от матери, другая от отца). Ген, определяющий доминантный признак обозначается заглавной буквой, например В (черный пигмент). Ген, определяющий рецессивный признак - строчной буквой, например b (коричневый пигмент). Доминантный признак проявляется в любом состоянии, поэтому по внешнему виду (фенотип) черной кошки (черный признак доминантный - В) невозможно определить состояние второй аллели и генотип этой кошки записывается как В-, то есть вторая аллель может быть как В (в этом случае говорят, что кошка гомозиготна по гену, ответственному за синтез черного пигмента), так и b (в этом случае кошка гетеризиготна). Рецессивный признак проявляется только в гомозиготном состоянии, поэтому если кошка шоколадная, нам известен ее генотип — bb.
А — ген агути, в его присутствии проявляются рисунчатые окрасы; а — рецессивная аллель, определяющая однотонные (без рисунка окрасы);
В — аллель гена черного пигмента; b— аллель гена коричневого пигмента (темно-коричневый); bi — самая рецессивная аллель гена коричного окраса (светло-коричневый) — у восточных кошек;
С — аллель гена равномерного распределения пигмента по корпусу; сs — рецессивная по отношению к С аллель акромеланистического окраса (сиамы, колор-пойнты);
D — ген, распределяющий пигмент по волосу. Доминантная аллель — насыщенный окрас. d — рецессивная аллель — ослабленный окрас (голубой при черном пигменте, лиловый при коричневом, кремовый при красном);
O — ген, определяющий красный окрас находится в половой хромосоме Х, поэтому коты с этим геном всегда красные (так как у них всего одна Х хромосома, а вторая Y), а кошки могут быть красными, если в обоих Х-хромосамах находятся доминантные аллели О или черепаховыми, если в одной Х-хромосоме аллель О, а в другой —о. Но так как в клетках функционирует только одна Х-хромосома, а другая инактивируется и процесс этот не предсказуем, получается, что в одних клетках остается аллель О и они окрашиваются в красный цвет, в других - о и в них проявляется другой окрас, заложенный в генотипе (черный, коричневый); o — рецессивная аллель внешне не проявляется;
S — серия аллелей белой пятнистости: Sw— самая доминантная аллель, определяющая окрас ван (цветное пятно на голове и окрашенный хвост); Sp — ген, вызывающий арлекиновый окрас (цветные пятна разбросаны отдельными участками на голове, холке, спине, крестцу); S — аллель биколорного соотношения цветов (примерно 1:1, окрашенность верхней и белой нижней части тела); s — аллель окраса без белой пятнистости; si — самая рецессивная аллель остаточных белый пятен (медальоны, белые лапки);
T — серия аллелей рисунчатых окрасов: Ta — самая доминантная определяет тикированных тэбби (абиссинская порода); T — аллель тигрового рисунка; tsp — аллель пятнистого рисунка; tb — аллель мраморного рисунка. Самая рецессивная аллель этой серии.
